＜ご参考資料＞
2003年2月18日
IBMとユナイテッドデバイス、アクセルリスが
天然痘治療薬研究グリッドで米国防総省を支援
−200万台以上のコンピューターをつなぐ天然痘研究グリッド・プロジェクト−
[米国ニューヨーク州アーモンク、テキサス州オースティン、
カリフォルニア州サンディエゴ 2003年2月5日(現地時間)発]
IBM(R)（本社：米国ニューヨーク州、CEO：サミュエル・パルミサーノ）、ユナイテッドデバイ
ス、アクセルリスの3社は5日(現地時間)、天然痘ウイルス感染後の特効薬としての可能性を秘めた新薬の開発に向けた世界的規模の研究をサポートするプロジェクトを発表し
ました。
大規模なコンピューティング「グリッド」を活用するこのプロジェクトでは、使っていないコンピューター資源を世界中のコンピューター・ユーザーから提供してもらい、天然痘
治療薬候補の幅広いコレクション形成をめざします。
この天然痘研究グリッド・プロジェクトの成果は、米国防総省国防長官室に届けられます。
世界保健機関(WHO)と疾病管理予防センター(CDC)によれば、天然痘感染後の特効薬は現状では存在しません。ワクチンの接種が唯一の予防法となりますが、WHOによ
る天然痘撲滅活動の結果、慣例的な接種は既に廃止されています。天然痘研究グリッド・プロジェクトでは、新しい抗ウイルス剤の発見に必要なコンピューター能力を、英国の
オックスフォード大学およびエセックス大学の優れた研究者や、ロバーツ研究所、スローンケタリング癌センター、ウエスタン・オンタリオ大学の天然痘の専門家に提供します。
天然痘研究グリッド・プロジェクトは、IBM、ユナイテッドデバイス、アクセルリス、およびEvotec OAIの技術とサービスをベースとしています。これら各社の技術
とサービスは既に商品化されており、現在多くの製薬会社やバイオ医薬品企業が新薬の発見・開発プロセスの改善および促進のために利用しています。グリッド・コンピューティ
ングという新たな技術によって、コンピューター処理能力、ネットワーク帯域幅、ストレージ容量などの演算リソースを大規模な研究プロジェクトを目的として共同利用すること
が可能になっているのです。
このプロジェクトでは、天然痘感染後に効く抗ウイルス剤を見つけるために、3,500万の薬物候補分子のライブラリーと天然痘ウイルスの複数のターゲット・タンパク質との
間の化学的相互作用を計算機化学を駆使して分析します。
IBMグリッド・コンピューティングのゼネラル・マネージャー、トム・ホークは次のように述べています。「IBMでは、他のプロジェクト・リーダーと共に、コンピュー
ター・ユーザーに対して参加を呼びかけています。眠っているコンピューター処理能力をこの価値あるプロジェクトに提供して、天然痘の特効薬開発に役立てることを検討してい
ただきたいのです。現在、グリッド・コンピューティングはビジネスに革命をもたらそうとしています。ライフサイエンスはその重点領域のひとつであり、グリッドを利用するこ
とによって薬のモデリングや開発をより速く効率的に実行できるようになります。」
個人のコンピューター・ユーザーは、www.grid.orgでスクリーンセーバーをダウンロード
することによって天然痘研究グリッド・プロジェクトに参加できます。このスクリーンセーバーは、ユーザーの作業を妨げることなく、コンピューターが使用されていないときに
その処理能力を提供し、コンピューターを世界的規模のグリッドに接続します。このグリッドは、仮想的なスーパーコンピューターとして機能し、研究室における通常の所要時間
の何分の1という時間で何十億もの分子を分析できます。処理が完了すると、このプログラムは、IBMのインフラストラクチャーによって運用しているユナイテッドデバイスの
データ・センターに結果を送り返し、次に分析する新しいデータを要求します。その後そのコンピューターで新しいデータが分析され、次回ユーザーがインターネットに接続した
ときに結果が送り返されます。
このプロジェクトは、www.grid.orgの研究プロジェクトのPatriotGridという
カテゴリーに属しています。PatriotGridは、世界初のバイオテロ対策専用の公共研究グリッドです。www.grid.orgでサインアップすると、参加者はこのカテゴリーに属するすべての研究プロジェク
トで積極的な役割を果たすことができるようになります。
ユナイテッドデバイスのCEO、エド・ハバード氏は次のように語っています。「私たちは既に、大規模なGlobal MetaProcessorグリッドを炭疽菌と癌の研
究に利用して大きな成功を収めています。天然痘の治療薬につながるようなこれらのターゲットの阻害物質を現時点で突きとめるには、最先端のアプリケーション、既存のインフ
ラストラクチャー、実証済みのグリッド・ソリューションを利用する以外にありません。この試みに参加できることを大変誇りに思っています。」
テクノロジーとパートナー
天然痘研究グリッド・プロジェクトは、以下の企業および教育機関の専門知識、資金、技術によって実現されています。
- ユナイテッドデバイス -- 安全なグリッド・ソリューションの市場をリードするユナイテッドデバイスは、このプロジェクトの全側面を統括しています。ユナイ テッドデバイスのGlobal MetaProcessorプラットフォームは、プロジェクトに参加しているサーバー、PC、ワークステーションのアイドル時の処理能力を、全世界に広がる既存のグ リッドに統合します。このグリッドは、広範な科学アプリケーションや高性能コンピューティング・アプリケーションを実行することができます。
- IBM --
天然痘研究グリッド・プロジェクトには、AIXやLinuxでDB2(R)データベースを実行する
IBM
pSeriesTM 690システムやSharkエンタープライズ・ストレージ・サーバーなど、IBMのインフラストラクチャーが活用されて
います。ユナイテッドデバイスのGlobal MetaProcessorプラットフォームでは、ホスト・データベース・システムとして利用されるのはDB2だけです。
DB2は、何十億もの仮想的な薬のスクリーニングを分析する約200万台のコンピューターによって提供されるデータのあらゆる側面を管理しつつ、1日あたり1,500万に
上るSQLクエリーを処理します。天然痘研究グリッド・プロジェクトのテクノロジーは、1月27日にIBMが発表した10種類の商用グリッド・オファリングの1つ、ライフ
サイエンス産業向け高速解析グリッドの一例となります。天然痘研究グリッド・プロジェクトにはIBMの従業員も参加できます。 - アクセルリス -- ライフサ イエンス分野の代表的ソフトウェア・デベロッパーの一員であるアクセルリスは、天然痘研究グリッド・プロジェクトの化合物スクリーニングをコンピューターで実行するために 使用される、高スループットのドッキング/スコアリング・ソフトウェアを提供します。アクセルリスのLigandFitは、3Dモデルを使って分子データを分析します。 LigandFitを利用すると、科学者・研究者は、その後の実験や新薬開発に向けてリード候補の適性を正確に予測し、優先順位をつけることができます。
- Evotec OAI -- 新薬の発見・開発プロセスのアウトソーシング・サービス・プロバイダーであるEvotec OAIは、活性部位を特定するための 薬のモデリング技術を提供しました。
- 主要大学と研究機関 -- オックスフォード大学では、エセックス大学およびロバーツ研究所の研究者と共に、アクセルリスのLigandFitで使用するター ゲットを用意しました。また、その巨大な分子ライブラリーをプロジェクトに提供しています。大学・研究所レベルでこのプロジェクトを統率しているのは、グラント・マクファ デン博士(ロバーツ研究所、ウエスタン・オンタリオ大学微生物学・免疫学科グラデュエート・チェアー)、スチュアート・シューマン博士(メモリアル・スローンケタリング癌 センター)、グレアム・リチャーズ教授(オックスフォード大学化学科主任)、およびクリス・レイノルズ教授(エセックス大学生物科学科)です。
- 米国陸軍感染症研究所 -- このチームは、米国防総省の下でこのプロジェクトを管理します。また、バイオテロや軍事目的での天然痘の利用に対処できる特効薬 を開発するために、可能性の高い候補分子に対してさらなる分析を進める機関のひとつでもあります。
アクセルリスの最高科学責任者、スコット・カーン博士は、次のように語っています。「テクノロジーや科学に関する私たちの専門知識を提供することによって、大量破壊
兵器となりうる天然痘の撲滅に貢献できればと思っています。テロとの戦いを目的としてテクノロジーおよび生物科学の最先端の組織と協力できることに大いなる意欲をかきたて
られています。」
IBMについて
IBMは世界最大のIT企業であり、80年間にわたって企業の革新を支援してきたリーダーです。IBMライフサイエンスは、研究、サービス、およびe-ビジネスの専門知識
から、データ管理、ストレージ管理、高性能コンピューティングにいたるIBMの経営資源を結集させて、ヘルスケアおよびライフサイエンス市場に新たなソリューションを提供
します。IBMについての詳細は、(www.ibm.com)でご覧いただけます。IBMライフサイ
エンスについての詳細は、(http://www.ibm.com/lifesciences)で、
IBMのグリッド・コンピューティング事業については、(www.ibm.com/grid)でご覧いただけます。
ユナイテッドデバイスについて
ユナイテッドデバイスは、セキュリティ性を備えたグリッド・ソリューション市場における第一人者です。ユナイテッドデバイスのMetaProcessorプラットフォーム
は、ネットワーク上の演算リソースを統合し、ライフサイエンス、ジオサイエンス、金融サービスなどの業界で、広範囲にわたる高性能のコンピューティング・アプリケーション
を稼動させる能力を持つエンタープライズ・グリッドを形成します。また同社は、大規模な研究向けに200万を超える装置から構成される世界最大のグリッドを運用していま
す。セキュリティ性を備えたグリッド・ソリューションの詳細については、ユナイテッドデバイスのWebサイト(www.ud.com)でご覧いただけます。現在使用していない演算能力をご提供いただける場合は、(www.grid.org)までお願いいたします。
アクセルリスについて
アクセルリスは、生物学者、化学者、材料科学者が製品設計、創薬、および開発に使用する科学データの演算、シミュレーション、管理・マイニング向けのソフトウェアを提供す
る有力プロバイダーです。アクセルリスのプラットフォーム・テクノロジーおよびコンサルティング・サービスにより、今日の大手研究組織に適した形での企業規模のソリュー
ションが可能になります。同社の研究の中核となる2つの主要センターはサンディエゴおよび英国ケンブリッジにあります。このセンターでは、有意義な協業プロジェクトを支援
する施設を伴って、研究活動と製品開発を結びつける活動に従事しています。アクセルリスは、Pharmacopeia社(Nasdaq:PCOP)の子会社です。
オックスフォード大学について
オックスフォード大学には世界規模の研究学科があり、英国内の大学でも随一の規模を誇る研究陣を擁しています。オックスフォード大学の化学科は西洋諸国で最大の規模を持っ
ており、化学科の卒業生や博士号を持つ学生で、米国・欧州各国の大学よりもオックスフォードで学ぶケースが増加しつつあります。天然痘研究グリッド・プロジェクトは、同学
科により実施され一般に高い評価を受けた癌スクリーンセーバー・プロジェクト(www.chem.ox.ac.uk/curecancer.htmlを参照)、および炭疽菌プロジェクト(www.chem.ox.ac.uk/anthrax/を参照)の流れを汲むものです。